Jaringan feri Kalimantan menggabungkan penyeberangan lokal dengan kapal penumpang jarak jauh. Kariangau–Penajam merupakan salah satu lintasan kendaraan penting, sementara Balikpapan terhubung dengan Jawa, Sulawesi dan wilayah lain melalui kapal penumpang nasional. Rute PELNI dari Surabaya dan Makassar juga singgah di Kalimantan sebelum melanjutkan perjalanan ke Indonesia timur. Operator utama mencakup ASDP dan PELNI.
